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Équipements et Services

L'installation fournit des techniques et services qui sont développés et adaptés pour les chercheurs qui ont besoin d'aide en glycomique. L'installation est répartie dans sept nœuds à travers le Canada et comprend également l'un des deux instruments 15 FT-ICR-MS au Canada, ainsi que l'un des huit synthétiseurs d'oligosaccharides entièrement automatisés dans le monde, le Glyconeer®.

 

Services et Techniques

Si vous avez des projets qui nécessitent une assistance en glycomique, mais que les techniques ne sont pas listées sur cette page, veuillez remplir le formulaire de demande.

SERVICE TECHNIQUE/ÉQUIPEMENT/BIBLIOTHÈQUES DESCRIPTION
Criblage de glycane

15 FT-ICR-MS
Spectromètre de masse Q Exactive Orbitrap
Q Exactive Orbitrap Classic-UHPLC avec détecteur FD
Q Exactive Orbitrap Gamme de Masse Ultra Élevée
Photomètre de masse

  • Analyser une bibliothèque de glycanes définie contenant plus de 400 composés (par exemple, les antigènes d'histo-groupe ABO et Lewis, les gangliosides, le lait maternel, les oligosaccharides végétaux et bactériens) pour étudier les interactions des glycanes avec les protéines cibles du client
  • Identifier, caractériser et quantifier les interactions protéines-glucides in vivo
R&D analytique Nano-ES
MALDI TOF/TOF
15 FT-ICR-MS
  • Caractériser des échantillons d'oligosaccharides
  • Analyser la composition, liaison et taille des polysaccharides
  • Décrire et quantifier des glucides dans des matrices d'échantillons complexes
  • Déterminer la structure des glycanes inhabituels ou modifiés
Synthèse de Glucides Synthèse automatisée des glycanes (Glyconeer 2.1)
Chromatographie semi-préparative
  • Synthèse personnalisée
  • Fournir des services de la conception de la molécule sonde à la purification finale
  • • Exemples de glucides pour achat immédiat : oligosaccharides, glycopeptides, composantes de base, sialosides inhabituels et glycosides Kdo, antigènes des groupes sanguins humains, sphingolipides, mimétiques et sondes enzymatiques, glycoconjugués. Consultez notre catalogue de composés ICI
Découverte de glycane-ligand Réseau de glycanes liquides (LiGA)quid Glycan Array (LiGA)
Puce à lectine avec analyse bicolore et monocolore
Essai Catch-release MS
Dosage biologique des nanoparticules liposomales (ZetaSizer)
  • Décrire des interactions protéine-glycane à partir de cellules/tissus entiers et d'échantillons purifiés
  • Identifier et quantifier les interactions glucides-protéines faibles qui ne sont généralement pas détectables par d'autres méthodes
Découverte de médicaments à base de glucides & criblage à haut débit Plate-forme entièrement automatisée et fermée pour le criblage cellulaire et ciblé
Analyse cellulaire quantitative à haute densité (Cellomics VTi, Molecular Devices ImageXpress Micro Systems)
Criblage optique quantitatif pour les essais cinétiques cellulaires (FLIPR)
  • Développer et valider de nouvelles cibles ou des essais cellulaires
  • Tests basés sur des images à haute densité, y compris le marquage cellulaire
  • Identifier, confirmer et développer des molécules hits
  • Utiliser des collections bioactives internes contenant des bibliothèques de glycanes (65 000 composés), des extraits de produits naturels (8 000 structures), des bibliothèques de petites molécules de type médicament (147 000 composés), des bibliothèques de Gram négatifs, des bibliothèques d'inhibiteurs de kinases et autres
  • Gestion et analyse de données dans le nuage, y compris les corrections de lots, l'ajustement de courbe, le filtrage de molécules hits et autres tâches d'analyse
Analyse biophysique et de biologie structurale Thermophorèse microscopique (Monolith Nanotempter)
Nano ITC (instruments TA)
Dichroïsme circulaire (spectropolarimètre Jasco J-815)
Cristallisation de protéines avec robot de manipulation de liquides (Mosquito Crystal Gryphon LCP)
Spectrométrie de masse (spectromètre de masse Orbitrap Fusion Lumos Tribid, système UPLC-SYNAPT G2)
RMN à haut champ (Bruker 600 MHz équipé d'une cryosonde à l'hélium)
  • Caractériser et quantifier les complexes biomoléculaires et leurs interactions moléculaires
  • Cristalliser les complexes protéiques avec des glycanes
  • Analyse glycoprotéomique
  • La RMN convient au criblage à haut débit
Glycobiologie moléculaire Souches de Streptomyces
Recombinaisons plasmidiques
Archives moléculaires (ADNc, ARNsh)
Dépôt d'enzymes actives sur les glucides
  • Exprimer des glycosidases spécialisées et des enzymes actives sur les glucides
  • Optimiser l'expression des protéines des vecteurs d'expression internes
Culture tissulaire et imagerie cellulaire Tri cellulaire (CyFlowTM Cube 6 V2m, BioSorter)
Collection de lignées cellulaires (humaine, mammifère, souris transgénique)
Poste de sécurité microbiologique de niveau de biosécurité II pour culture cellulaire
Microscope à haute densité (Molecular Devices ImageXpress Micro Confocal Imaging System)
  • Étudier les fonctions cellulaires, l'expression des gènes, la cytotoxicité cellulaire
  • Analyser les micro-organismes, les cellules individuelles et les particules microscopiques
  • Maintenir, entreposer, développer et expérimenter des lignées cellulaires pour les clients
Analyse du Glycome Microbien GC-MS (Ensemble technologique Agilent 5977B)
MALDI-TOF MS (Bruker UltrafleXtreme)
NMR (Bruker Ascend TM600 Hyphenated)
  • Extraire les polysaccharides du biofilm
  • Analyser la structure des glycanes microbiens
Glyco-ingénierie Souche E. coli spécialisée avec un système double plasmide - optimisation de l'expression des glycoprotéines
In vitro Remodelage enzymatique in vitro des glycanes protéiques
  • Réduire l'hétérogénéité et améliorer l’uniformité de la glycosylation
  • Modifier les propriétés pharmacocinétiques des protéines glycosylées

Réseau Canadien de la Glycomique
E5-33 Gunning/Lemieux Chemistry Centre
University of Alberta, T6G 2G2
Tél.: 780-492-6204
Téléc.: 780-492-4147

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